Az MMÖNK legfelsőbb szerve a Tanács
Az MMÖNK alapszabályzata alapján a Tanács jelentősebb hatáskörei, feladatai:
- megerősíti a Tanács tagjainak mandátumát;
-
kinevezi és felmenti az elnököt;
-
kinevezi és felmenti az Ellenőrző Bizottság tagjait;
-
kinevezi és felmenti a bizottsági tagokat;
-
felügyeli az elnök és az alelnök, illetve alelnökök munkáját;
-
elfogadja az MMÖNK alapszabályzatát, a Tanács ügyrendjét és egyéb általános szabályzatait;
-
elfogadja az MMÖNK költségvetését és zárszámadását;
-
rendelkezik az MMÖNK ingatlanvagyona felett;
-
a nemzeti közösség szempontjából fontos szakintézeteket és egyéb szervezeteket alapít, illetve azok társalapítója;
-
kinevezi az általa alapított intézetek és egyéb szervezetek igazgatóit;
-
kinevezi az általa alapított és társalapított intézetek tanácsaiba küldött közösségi tagokat;
-
véleményezi a társalapított intézetek igazgatójelöltjeinek a tisztség betöltésére vonatkozó alkalmasságát;
-
elfogadja az általa alapított intézetek alapító okiratait és szükség szerint alapszabályait;
-
együttműködik a községi magyar nemzeti önkormányzatokkal;
-
együttműködik a magyar nemzetiségi parlamenti képviselővel;
-
együttműködik a szlovén kormánnyal, a szlovén országgyűléssel, a minisztériumokkal és ezek hivatalaival;
-
javaslatokat, kezdeményezéseket, véleményeket terjeszt saját hatáskörét illetően a szlovén országgyűlés, a kormány és egyéb országos szervek elé;
-
együttműködik a magyar kormánnyal, a magyar országgyűléssel, megyei, helyi és kisebbségi önkormányzataival, a kisebbségben élő magyarok szervezeteivel, valamint összmagyar jellegű szervezetekkel;
-
együttműködik a más országokban élő magyar nemzeti közösségek szervezeteivel;
-
együttműködik egyéb kisebbségekkel és a nemzetközi szervezetekkel.
Tanácstagok
Az MMÖNK Tanácsa tagjainak száma 21. A tanácstagokat az alábbi községi magyar nemzeti önkormányzatok tanácsa nevezi ki:
- Lendva Községi Magyar Nemzeti Önkormányzati Közösség (10 tagot)
- Dobronak Községi Magyar Önkormányzati Nemzeti Közösség (4 tagot)
- Moravske Toplice Községi Magyar Nemzeti Önigazgatási Közösség (3 tagot)
- Šalovci Községi Magyar Nemzeti Önkormányzati Közösség (2 tagot)
- Hodos Községi Magyar Nemzeti Önkormányzati Közösség (2 tagot)
Az MMÖNK Tanácsának a folyó mandátumban jelenleg 19 tagja van, ugyanis a Lendva Községi Magyar Nemzeti Önkormányzati Közösség az MMÖNK Tanácsába 10 tag helyett 8 tagot nevezett ki.

A Tanács tagjai:
Lendva Községi Magyar Nemzeti Önkormányzati Közösség
- Horvat Tomi
- Jambor Bence Szeréna
- dr. Kasaš Habjanič Mihael
- Magyar Janez
- Požonec Robert
- Tivadar Eva
- Varga Štefan István
- Vass Boglárka
Dobronak Községi Magyar Önkormányzati Nemzeti Közösség
- Car Luka
- Toplak Alenka
- Varga Edit
- Varga Teodor
Moravske Toplice Községi Magyar Önkormányzati Nemzeti Közösség
- Horvat Atila
- Vugrinec Alen
- Vugrinec Zsuzsi
Hodos Községi Magyar Önkormányzati Nemzeti Közösség
- Roman Silvija
- Könye Erika
Šalovci Községi Magyar Önkormányzati Nemzeti Közösség
- Kranjec Josip
- Orban Dušan
A Tanács tagjainak mandátuma négy évre szól. A Tanácsot a mindenkori elnök képviseli. 2023. január 9-től az MMÖNK Tanácsának elnöke Orban Dušan úr.